北京兒童醫院技術力量雄厚。擁有重點學科兒科學，國家兒童腫瘤監測中心、國家呼吸系統疾病臨床醫學研究中心、國家中西醫協同旗艦醫院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點專科，5個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫療中心。醫院設有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內地位，是中華醫學會兒科學分會、兒外科分會，中國醫師協會小兒外科醫師分會，中華護理學會兒科專業委員會主任委員單位。
北京兒童醫院醫院內分泌科開設肥胖與減重門診，篩查導致肥胖的內分泌疾病(如垂體、腎上腺、甲狀腺疾病、下丘腦綜合征等)，評估營養狀況，進行營養代謝狀態分析，并對患者進行個體化減重指導，幫助患者達到并維持目標體重。
目前普遍存在的2個極端：生長速度的減慢常不引起患兒家長的察覺和重視，往往把矮小當作“晚長”，錯過了矮小的診斷時機。另一個極端是正常身高卻不滿足，或者有特殊職業要求，尋求方法改善身高。因此，我院在普通內分泌專科以外，特設矮小癥專科門診，以幫助解答和評估矮小是否存在。
鞏純秀主要研究方向為兒童糖尿病領域，涵蓋兒童糖尿病流行病學研究、生存、代謝控制狀況及胰島素抵抗相關疾病范化研究。先天性高胰島素性/新生兒糖尿病臨床與遺傳學研究。性腺研究主要包括嬰幼兒乳房發育臨床監測、DSD病因學及Kallmann綜合征的基因學研究、小陰莖的、AAA綜合征的遺傳學研究、DSD患者體格發育研究、Silver Russule 綜合征遺傳學研究等。同時承擔研究生教學以及留學生英文教學。
